Vienintelis AB „Regitra“ akcininkas – Lietuvos Respublikos valstybė, atstovaujama Lietuvos Respublikos vidaus reikalų ministerijos.  Ši ministerija valdo ir 100 proc. bendrovės akcijų.

Įstatinį kapitalą sudaro 17 047 246  paprastųjų vardinių akcijų, kurių kiekvienos nominalioji vertė 1,00 euras.